Comprehensive Assessment of Genotype Imputation Performance

نویسندگان
چکیده

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Assessment of genotype imputation methods

Several methods have been proposed to impute genotypes at untyped markers using observed genotypes and genetic data from a reference panel. We used the Genetic Analysis Workshop 16 rheumatoid arthritis case-control dataset to compare the performance of four of these imputation methods: IMPUTE, MACH, PLINK, and fastPHASE. We compared the methods' imputation error rates and performance of associa...

متن کامل

Genotype imputation.

Genotype imputation is now an essential tool in the analysis of genome-wide association scans. This technique allows geneticists to accurately evaluate the evidence for association at genetic markers that are not directly genotyped. Genotype imputation is particularly useful for combining results across studies that rely on different genotyping platforms but also increases the power of individu...

متن کامل

Assessment of Genotype Imputation Performance Using 1000 Genomes in African American Studies

Genotype imputation, used in genome-wide association studies to expand coverage of single nucleotide polymorphisms (SNPs), has performed poorly in African Americans compared to less admixed populations. Overall, imputation has typically relied on HapMap reference haplotype panels from Africans (YRI), European Americans (CEU), and Asians (CHB/JPT). The 1000 Genomes project offers a wider range o...

متن کامل

Comparing performance of modern genotype imputation methods in different ethnicities

A variety of modern software packages are available for genotype imputation relying on advanced concepts such as pre-phasing of the target dataset or utilization of admixed reference panels. In this study, we performed a comprehensive evaluation of the accuracy of modern imputation methods on the basis of the publicly available POPRES samples. Good quality genotypes were masked and re-imputed b...

متن کامل

assessment of the park- ang damage index for performance levels of rc moment resisting frames

چکیده هدف اصلی از طراحی لرزه ای تامین ایمنی جانی در هنگام وقوع زلزله و تعمیر پذیر بودن سازه خسارت دیده، پس از وقوع زلزله است. تجربه زلزله های اخیر نشان داده است که ساختمان های طراحی شده با آیین نامه های مبتنی بر نیرو از نظر محدود نمودن خسارت وارده بر سازه دقت لازم را ندارند. این امر سبب پیدایش نسل جدید آیین نامه های مبتنی بر عملکرد شده است. در این آیین نامه ها بر اساس تغییرشکل های غیرارتجاعی ...

15 صفحه اول

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Human Heredity

سال: 2018

ISSN: 0001-5652,1423-0062

DOI: 10.1159/000489758